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ChIP-seq
(Chromatin Immuno-Precipitation Sequencing)

Campaignキャンペーン

毎年ご好評いただいております、『冬のシーケンスキャンペーン』が今年も開催中です。
お得な価格でご提供しておりますので、是非この機会にご利用下さい。
※本キャンペーン価格は、データ取得まで(Raw Data納品)の価格となります。
 核酸抽出やデータ解析も承りますので、お気軽ご相談下さい。

キャンペーン内容は下記のバナーよりご確認下さい。

Overviewサービス概要

『ChIP-seq(Chromatin Immuno-Precipitation Sequencing)』は、転写因子やヒストンとDNAの複合体を抗体で免疫沈降し、濃縮精製されたDNA断片をシーケンスすることで、転写因子と相互作用していたDNA領域や、特定のヒストン修飾が濃縮されたDNA領域を明らかにする手法です。
特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効な手法となります。

ChIP-seqの利用用途 (ATAC-seqとの違い)

ChIP-seqの利用用途

特定の転写因子やヒストン修飾に興味が定まっている場合に有効

  • ゲノム上の転写因子やヒストン修飾の標的を捕捉したい
  • 疾患や細胞変化に関連する重要な転写因子やヒストン修飾を定義したい

ATAC-seqの利用用途

注目したい細胞変化に関わる転写因子やヒストン修飾の探索に有効

  • 細胞の遺伝子発現を制御する転写因子を予測したい
  • 細胞に特異的なエンハンサー領域を予測したい
  • 細胞状態の維持・変化に繋がるエピゲノム制御の機序を予測したい

参考記事

関連メニュー

Price参考価格

プラン リード長 データ量
リード数
参考価格
(/1サンプル)
参考納期
(サンプル受領日から)
サンプル要件
キャンペーン価格
ChIP-seq
(ChIPed-DNAから)
生データプラン 150×2 paired-end
(PE150)
6 Gb
40.0M reads
31,000円+税
36,000円+税
5-7週
ChIP-seq ベーシック解析プラン - - お問い合わせ お問い合わせ -
  • ・ データ量はお客様のご希望に応じて変更できますので、お問い合わせください。
  • ・ 参考納期は弊社がサンプルをお預かりした日から起算した週数です。
  • バイオインフォマティクス解析のみでも承っておりますので、お問い合わせください。

Planサービスプラン

 

RAW DATA PLAN

RD

生データプラン

取得したraw data(生データ)のみをご納品するプランです。既に解析方針を定められているお客様がご自身でデータ解析を進められることを前提としたプランです。

BASIC PLAN

BS

ベーシック解析プラン

基本的な解析を実施するプランです。マッピング、ピークコール後、各種描画データを作成の上、群間比較解析前にシグナル傾向を把握することができます。(※InputコントロールやIgGコントロールの有無に関わらずご依頼可能です。)

STANDARD PLAN

SD

スタンダード解析プランオススメ人気No.1

ベーシックプランの解析内容に加え、ご希望の解析をオプションでお選びいただき実施するプランです。

オプション解析メニュー

  • その他、下記のような3群間以上での比較解析も対応可能でございます。
    お気軽にお問合せください。

    ・k-meansクラスタリング解析

    ・ベイズ推定を用いた多群比較解析

    ・時系列変動ピークの検出

*実施のために変動ピーク領域の検出が必要となります。

ORDER MADE PLAN

OM

オーダーメイド解析プラン

ご研究目的やご要望の図版、参考文献等に応じて、標準サービスメニュー外のカスタム解析を実施します。解析目的・内容の擦り合わせのため、原則としてご依頼前に当社研究員とのWebミーティングが必要です。

Toolピーク比較解析ツール
「RIAS® Peak Explorer」

RIAS® Peak Explorerは、ピーク比較解析ツールです。
対象となるエピゲノム制御領域の生物学的な意義・役割を予測していく際、複雑なコーディングやツールの使い分けをすることなく、
簡易的・直感的に、複数のATAC-seqデータ・ChIP-seqデータ・ゲノムの比較解析ができます。

ChIP-seqのご依頼の場合、当社開発のピーク比較解析ツール「RIAS(ライアス) Peak Explorer」を120日間ご利用頂けます。
本ツールは、以下のように活用いただけます。

  • 複数転写因子に共通あるいは各々に特異的な結合領域を予測する
  • 転写因子が条件の違いによりどのように結合領域を変化させるかを予測する
  • 転写因子の条件特異的な標的遺伝子を予測する
  • 細胞特異的なエンハンサー領域にどのような転写因子が結合するかを予測する
  • 医学生命科学研究者のためのサポートクラウドツール

    Example解析例

    SCROLL