『シングルセル 3'RNA-seq』では、10x Genomics社のプラットフォームを用いてシングルセルレベルで遺伝子発現を網羅的に解析します。
バルクでの解析では個々の細胞の転写産物がプールされ構成細胞の平均値が結果となりますが、シングルセル解析では細胞一つ一つについて解析することができ、バルク解析で見えてこなかった細胞ごと発現プロファイルを得ることができます。
シングルセル解析において品質の良いデータを得るためには、細胞調製の工程が非常に重要となります。コストに見合う試験結果をご提供できるよう、必要に応じてご依頼前に試験サンプルに関してインタビューを行い、品質の良いデータを得るための条件検討サポートを標準サービスとして実施しています。
条件検討サポート前の細胞写真
当社サポート後の細胞写真
さらに、シングルセル解析では細胞一つ一つに対しシーケンスデータが得られるため、バルク解析に比べデータ構造は巨大かつ複雑になります。そのため、データ処理、解析には多大な解析リソースが必要となります。
当社では、細胞調製における条件検討のサポートや、カウンセリングに基づいたカスタム性の高いシングルセル解析プロセスの構築、論文作成を視野に入れた図版作成など、柔軟な研究支援を行い、お客様の研究プロジェクトにおけるシングルセル解析の威力を最大化します。
シングルセルレベルで解析する意義
- 1．細胞の分類：データをもとにした分類で細胞集団の内訳の把握
- 2．細胞集団の比較：細胞集団間の差異、機能的特徴の発見
- 3．新しい細胞集団の発見：細胞亜集団の発見・機能解析によるバイオマーカー・創薬標的の発見
- 4．細胞決定の道筋をたどる：擬似的な時間軸の発見・細胞運命分岐の発見
